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BIOINGENIERIE ET DYNAMIQUE MICROBIENNE AUX INTERFACES ALIMENTAIRES

(Equipe Mixte d’Accueil n°3733, ISARA Lyon - Université Lyon 1)

Le laboratoire BIODYMIA, créé le 1er janvier 2011 sous la double tutelle de l’Université Lyon 1 et de l’ISARA Lyon est issu de la fusion du LRGIA (Laboratoire de Recherche en Génie Industriel Alimentaire) et de l’unité EMC (Ecosystèmes Microbiens Complexes).
Il regroupe sur ses 2 sites de l’Agrapôle à Lyon-Gerland (ISARA) et du technopole Alimentec (dans les locaux du site de Bourg en Bresse de l’IUT Lyon 1) environ 25 personnes dont 12 enseignants-chercheurs.

Photo : ©Eric Le Roux/Communication/UCBL

L’enjeu des recherches conduites par l’équipe concerne la maîtrise de la qualité microbiologique des productions alimentaires avec une focalisation sur les produits frais et les surfaces à leur contact au cours de leur élaboration puis de leur conservation.

La question de la dynamique microbienne aux interfaces alimentaires est centrale dans ces travaux. Ceux-ci concernent :

  • l’étude des mécanismes de bioprotection d’aliments traditionnels : il s’agit d’identifier et caractériser des agents de biopréservation (bactéries lactiques, protéines ou peptides antibactériens (lactoferrine et ses fragments, bactériocines) et de façon plus récente des extraits végétaux (huiles essentielles notamment)) en système alimentaire réel, modèle ou de façon isolée pour une meilleure compréhension de leur mécanisme d’action
  • le développement de stratégies innovantes d’association agents de biopréservation-biopolymères (par dispersion, encapsulation, incorporation dans des matériaux) pour favoriser leur stabilité et leur efficacité (notamment via un relargage contrôlé)

- Site de Lyon (ISARA) :
ISARA, Département Production Agro-Alimentaire et Qualité, Agrapôle, 23 rue Jean Baldassini, F-69 364 Lyon cedex 07
Tel : +33 (0)4 27 85 85 85
Fax : +33 (0)4 27 85 86 37
E-mail : ydemarigny@isara.fr

- Site de Bourg en Bresse (IUT Lyon 1) :
Technopole Alimentec, rue Henri de Boissieu, F-01000 Bourg en Bresse
Tel : +33 (0)4 74 45 52 52
Fax : +33 (0)4 74 45 52 53
E-mail : pascal.degraeve@univ-lyon1.fr

Les sites

Le site de Bourg-en-Bresse de BioDyMIA est hébergé par le Technopôle Alimentec.
Le site de Lyon est hébergé par l’ISARA Lyon

La recherche

Pour visualiser le poster de présentation des activités de recherche de BioDyMIA, cliquez sur l’icône ci-dessous :

PDF - 858 ko

La thématique de recherche de l’équipe s’inscrit dans le domaine de l’étude des interactions microbiennes aux interfaces, avec pour objectif la maîtrise des contaminations des aliments par les flores d’altération ou pathogènes au cours de leur itinéraire technologique d’élaboration puis de conservation.
L’activité du laboratoire dans le domaine de la maîtrise de la qualité hygiénique des aliments et de leur environnement de production porte ainsi à la fois sur :

- l’étude des mécanismes de biopréservation d’aliments traditionnels avec une expertise concernant les filières fromagères. Le laboratoire a ainsi participé à la mise en évidence de la présence de consortia microbiens inhibant le développement de souches de Listeria monocytogenes tout au long du cycle d’utilisation de planches en bois employées comme support d’affinage pour une production fromagère traditionnelle. Ce type de travaux contribue par exemple à établir les bases scientifiques nécessaires pour étayer des recommandations dans des guides de bonnes pratiques de fabrication destinés aux professionnels d’une filière de production.

  • Les objectifs sont de :
    • Prévenir les accidents technologiques,
    • Maintenir des pratiques en lien avec la typicité des produits alimentaires,
    • Garantir la qualité hygiénique et sensorielle des productions localisées

- le développement d’approches innovantes pour améliorer la qualité hygiénique des productions alimentaires. Celles-ci ont jusqu’à présent essentiellement reposé sur la fonctionnalisation de matériaux (par exemple d’emballage (films éther-cellulosiques, matériaux rigides biodégradables à base de farine de maïs) ou textiles (coton-polyester) par des molécules antimicrobiennes non volatiles (nisine, lysozyme, PHMB, argent…)). Ces agents antimicrobiens peuvent être incorporés dans ces matériaux au cours de leur élaboration ou déposés sur ces matériaux après celle-ci. Les modes d’incorporation et/ou les techniques de dépôt de ces agents antimicrobiens, la structuration de ces matériaux et la nature des interactions qu’ils établissent avec ces agents antimicrobiens sont autant de facteurs qui conditionnent leur stabilité comme leur activité antimicrobienne et leur mode d’action qui dépend notamment des cinétiques de transfert de ces agents antimicrobiens vers la surface des matrices alimentaires à leur contact.

La compréhension fine des mécanismes par lesquels des micro-organismes contribuent à la biopréservation d’aliments dans des systèmes traditionnels permet désormais aussi d’envisager d’étendre leur emploi à la conservation d’autres produits alimentaires tels que les produits frais ce qui constituerait une innovation tout à fait originale. Sur un plan scientifique, le développement de ces applications repose notamment sur la maîtrise des interactions microbiennes aux interfaces (en particulier à la surface des aliments et des matériaux à leur contact).

La conduite des travaux de l’équipe est ainsi fortement interdisciplinaire nécessitant d’associer des compétences en microbiologie, physico-chimie et biochimie des systèmes alimentaires (incluant les matériaux au contact des aliments). Le laboratoire est ainsi structuré en 3 pôles de compétences qui rassemblent chacun du personnel et des équipements sur les 2 sites de Lyon et de Bourg en Bresse. Un coordonnateur de chacun de ces 3 pôles participe à l’animation de l’équipe pour favoriser l’interdisciplinarité.

Les activités de recherche sont conduites avec des partenaires publics (collectivités territoriales notamment), des centres techniques et/ou des entreprises, soit dans le cadre d’appels d’offre régionaux, nationaux (ANR…) ou européens, soit dans le cadre de partenariats directs.

Production scientifique

Articles in international scientific journals of BIODYMIA

(Université Lyon 1 – ISARA Lyon)

former acronyms :

LRGIA (Université Lyon 1) and EMC (ISARA Lyon)

Articles (1) et revues (2) acceptés

Cherrat L., Dumas E., Bakkali M., Degraeve P., Laglaoui A., Oulahal N. Effect of five essential oils on the cell viability, membrane integrity and membrane fluidity of Listeria innocua and Escherichia coli. Journal of Essential Oil Bearing Plants (IF 2013 0,187).

Gharsallaoui A., Oulahal N., Joly C., Degraeve P. (in press) Nisin as a food preservative : Part 1 : Physicochemical properties, antimicrobial activity, and main uses. Critical Reviews in Food Science and Nutrition (revue acceptée en janvier 2013). (IF 2012 : 4,820)

Gharsallaoui A., Oulahal N., Joly C., Degraeve P. (in press) Nisin as a food preservative : Part 2 : Antimicrobial polymer materials containing nisin. Critical Reviews in Food Science and Nutrition (revue acceptée en janvier 2013). (IF 2012 : 4,820)

2016 : 3 articles

Benelhadj S., Fejji N., Degraeve P., Attia H., Ghorbel D, Gharsallaoui A. (2016). Properties of lysozyme / Arthrospira platensis (Spirulina) proteins complexes for antimicrobial edible food packaging. Food Chemistry, 194, 1056-1063.

Cottaz A., Khalil F., Jbilou F., Galland S., Adt I, Degraeve P., Joly C. (2016). Poly(butylene succinate-co-butylene adipate) / polyethylene oxide blends for controlled release materials : a morphological study. Journal of Applied Polymer Sciences, 133, ??- ??.

Jiménez-Martín E., Antequera Rojas T., Gharsallaoui A., Ruiz Carrascal J., Pérez-Palacios T. (2016). Fatty acid composition in double and multilayered microcapsules of ω-3 as affected by storage conditions and type of emulsions. Food Chemistry, 194, 476-486.

2015 : 13 articles dont 11 avec IF

Jrad Z., El Hatmi H., Adt I., Khorchani T., Degraeve P. ; Oulahal N. (2015). Anti-microbial activity of camel milk casein and its hydrolysates. Acta Alimentaria, 44, 609-616. (IF 2013 : 0,427)

Trinh N. T. T., Lejmi R., Gharsallaoui A., Dumas E., Degraeve P., Thanh M. L., Oulahal N. (2015). Effect of emulsification and spray-drying microencapsulation on the antilisterial activity of transcinnamaldehyde. Journal of Microencapsulation, 32, 719-723. (IF 2013 : 1,878)

Demarigny Y., Soldat V., Gemelas L. (2015). From Streptococcus lactis to Lactococcus lactis : A qualitative and quantitative analysis of the scope of research undertaken around a microbial concept. Journal of Scientometric Research, 4, 61-69. (pas d’IF)

Jbilou F., Dole P., Degraeve P., Ladavière C., Joly C. (2015). A green method for PolyButylene Succinate recycling : depolymerization catalyzed by lipase B from Candida antarctica during reactive extrusion. European Polymer Journal, 68, 207-215. (IF 2013 : 3,242).

Colak B. Y., Peynichou P., Galland S., Oulahal N., Assezat G., Prochazka F., Degraeve P. (2015) Active biodegradable sodium caseinate films manufactured by blown-film extrusion : Effect of thermo-mechanical processing parameters and formulation on lysozyme stability. Industrial Crops and Products, 72, 142-151. (IF 2013 : 3.208).

Ben Said A., Guinot C., Ruiz J.C., Charton F., Dole P., Joly C. Chalamet Y. (2015). Purification of post-consumer polyolefins via supercritical CO2 extraction for the recycling in food contact applications. The J. Supercrit. Fluids, 98, 25-32 (IF 2014 : 2,571).

Jrad Z., Oulahal N., Adt I., Khorchani T., Degraeve P., El-Hatmi H. (2015). Camel colostrum : Nutritional composition and improvement of the antimicrobial activity after enzymatic hydrolysis. Emirates Journal of Food and Agriculture, 27(4), 384-389.

Jimenez-Martin E., Gharsallaoui A., Perez-Palacios T., Ruiz Carrascal J., Antequera Rojas T. (2015). Volatile compounds and physicochemical characteristics during storage of microcapsules from different fish oil emulsions. Food and Bioproducts Processing, 96, 52-64.(IF 2014 : 2,474)

Jimenez-Martin E., Gharsallaoui A., Perez-Palacios T., Ruiz Carrascal J., Antequera Rojas T. (2015). Suitability of using monolayered and multilayered emulsions for microencapsulation of ω-3 fatty acids by spray drying : effect of storage at different temperatures. Food and Bioprocess Technology, 8, 100-111 (IF 2013 : 3,126)

Colak B. Y., Gouanvé F., Degraeve P., Espuche E., Prochazka F. (2015). Study of the influences of film processing conditions and glycerol amount on the water sorption and gas barrier properties of novel sodium caseinate films Journal of Membrane Science 478, 1-11 (IF 2013 : 4,908)

Trinh N. T. T., Dumas E., Tranh M. L., Degraeve P., Ben Amara C., Gharsallaoui A., Oulahal N. (2015). Effect of a Vietnamese Cinnamomum cassia essential oil and of its major component trans-cinnamaldehyde on the cell viability, membrane integrity, membrane fluidity and proton motive force of Listeria innocua. Canadian Journal of Microbiology, 61, 263–271 (IF 2013 : 1,199)

Ormus S., Oulahal N., Noël C., Degraeve P., Gharsallaoui A. (2015). Effect of low methoxyl (LM) pectin complexation on the thermal and proteolytic inactivation of lysozyme : A kinetic study. Food Hydrocolloids, 43, 812-818. (IF 2013 : 4,280)

Léonard L., Beji O., Arnould C., Noirot E., Bonnotte A., Gharsallaoui A., Degraeve P., Lherminier J., Saurel R., Oulahal N. (2015). Preservation of viability and anti-Listeria activity of lactic acid bacteria, Lactococcus lactis and Lactobacillus paracasei, entrapped in gelling matrices of alginate or alginate/caseinate. Food Control, 47, 7-19. (IF 2012 : 2,738)

2014 : 11 articles dont 8 avec IF

Jrad Z., Girardet J-. M., Adt I., Oulahal N., Degraeve P., Khorchani T., El Hatmi H. (2014). Antioxidant activity of camel milk casein before and after in vitro simulated enzymatic digestion Mljekarostvo/Dairy, 64, 287-294. (IF 2012 : 0,30)

Jbilou F., Galland S., Telliez C., Akkari Z., Roux R., Oulahal N., Dole P., Joly C., Degraeve P. (2014). Influence of some formulation and process parameters on the stability of lysozyme incorporated in corn flour- or corn starch-based extruded materials prepared by melt blending processing. Enzyme and Microbial Technology, 67, 40-46 (IF 2013 : 2.936).

Ly-Chatain M.H. (2014). The factors affecting effectiveness of treatment in phages therapy. Frontiers in Microbiology, 5, article number 51, DOI:10.3389/fmicb.2014.0005. (IF attendu pour juillet 2014)

Khalil F., Galland S., Cottaz A., Joly C., Degraeve P.(2014) Polybutylene succinate adipate/starch blends : A morphological study for the design of controlled release films. Carbohydrate Polymers, 108, 272-280. (IF 2012 : 3,479)

Bayarri M., Oulahal N., Degraeve P., Gharsallaoui A. (2014). Properties of lysozyme/low methoxyl (LM) pectin complexes for antimicrobial edible food packaging. Journal of Food Engineering, 131, 18-25. (IF 2012 : 2,276)

Gemelas L., Degraeve P., Demarigny Y. (2014). The citrate metabolism in homo- and heterofermentative LAB : a selective means of becoming dominant over other microorganisms in complex ecosystems. Food and Nutrition Sciences, 5, 953-969. (IF =0,43 dans ISI Web of Knowledge)

Nguyen-Thi P., Dupas C., Adt I., Degraeve P., Ragon M., Missaoui M.-F., Novelli E., Segato S., Phan The D.,
Oulahal N. (2014) Partial characterisation of peptides inhibiting Listeria growth in two Alpine cheeses. Dairy Science and Technology, 94, 61-72. (IF 2012 : 1.380)

Léonard L., Degraeve P., Gharsallaoui A., Saurel R., Oulahal N. (2014). Design of biopolymeric matrices entrapping bioprotective lactic acid bacteria to control Listeria monocytogenes growth : comparison of alginate and alginate-caseinate matrices entrapping Lactococcus lactis subsp. lactis cells. Food Control, 37, 200-209. (IF 2012 : 2.738)

Jrad Z., El Hatmi H., Adt I., Girardet J.-M., Cakir-Kiefer C., Degraeve P., Khorchani T., Oulahal N. (2014) Antimicrobial, radical scavenging and angiotensin-I-converting enzyme inhibitory activities of camel colostrum, colostral whey, and milk proteins before and after hydrolysis by gastro-intestinal enzymes. Dairy Science and Technology, 94, 205-224 (IF 2012 : 1.38)

Messaoud M., Chadeau E., Chaudouët P., Oulahal N., Langlet M. (2014). Quaternary ammonium-based composite particles for antibacterial finishing of cotton-based textiles. Journal of Materials Science and Technology, 30, 19-29. (IF 2012 : 1.198)
Demarigny Y., Gerber P. (2014) Usefulness of natural starters in food technology. Food and Nutrition Science, 5, 1679-1691

2013 : 5 articles dont 4 avec IF

Jbilou F., Joly C., Galland S., Belard L., Desjardin V., Bayard R., Dole P., Degraeve P. (2013). Biodegradation study of plasticised corn flour / poly(butylene succinate-co-butylene adipate) blends. Polymer Testing, 32, 1565-1575. (IF 2012 : 1.646)

Gemelas L, Rigobello V, Ly-Chatain MH, Demarigny Y (2013) Diversity of the Lactococcus type population in cow and goat’s raw milks. Food and Nutrition Sciences, 4, 49-58. (nouveau journal, IF à venir en 2013)

Ly-Chatain MH, Moussaoui S, Vera A, Rigobello V, Demarigny Y (2013) Antiviral effect of cationic antimicrobial compounds on bacteriophages. Frontiers in Microbiology, 4(3), 1-6. (IF 2013 : 3.941)

Léonard L., Gharsallaoui A., Ouaali F., Degraeve P., Waché Y., Saurel R., Oulahal N. (2013). Preferential localization of Lactococcus lactis cells entrapped in a caseinate/alginate phase separated system. Colloids and Surfaces B : Biointerfaces, 109, 266-272. (IF 2012 : 3.554)

Heikkinen S. L., Kirsi S. Mikkonen K. S., Pirkkalainen K., Serimaa R.,Joly C., Tenkanen M. (2013). Specific enzymatic tailoring of wheat arabinoxylan reveals the role of substitution on xylan film properties. Carbohydrate Polymers, 92, 733-740. (IF 2012 : 3.479)

2012 : 8 articles avec IF

Demarigny Y (2012) Fermented food products made with vegetable materials from tropical and warm countries : microbial and technological considerations. International Journal of Food Science & Technology 47 : 2469–2476. (IF 2012 : 1.24)

Chadeau E., Dumas E., Adt I., Degraeve P., Noël C., Girodet C., Oulahal N. (2012). Assessment of the mode of action of polyhexamethylene biguanide against Listeria innocua by Fourier transformed infrared spectroscopy and fluorescence anisotropy analysis. Canadian Journal of Microbiology, 58, 1353-1361. (IF 2010 : 1.477)

Lignitto L., Segato S., Balzan S., Cavatorta V., Oulahal N., Sforza S., Degraeve P., Galaverna G., Novelli E. (2012). Preliminary investigation on the presence of peptides inhibiting the growth of Listeria innocua and Listeria monocytogenes in Asiago d’Allevo cheese. Dairy Science and Technology, 92, 297-308. (IF 2011 : 1.183)

Chadeau E., Brunon C., Degraeve P., Leonard D., Grossiord C., Bessueille F., Cottaz A., Renaud F., Ferreira I., Darroux C., Simon F., Rimbault F., Oulahal N. (2012). Evaluation of antimicrobial activity of a PolyHexaMethyleneBiguanide-coated textile by monitoring both bacterial growth (ISO 20743/2005 standard) and viability (Live/Dead® BacLight™ kit). Journal of Food Safety, 32, 141-151 (IF 2010 : 0.702)

Vera A., Ly-Chatain M. H., Rigobello V., Demarigny Y. (2012) Description of a French natural sourdough over 10 consecutive days. Focus on the lactobacilli microbiota. Antonie Van Leeuwenhoek, 101, 369-377. (IF 2010 : 1.673)

Jbilou F., Ayadi F., Galland S., Joly C., Dole P., Belard L., Degraeve P. (2012). Effect of shear stress extrusion on plasticized corn flour structure : proteins role and distribution. Journal of Applied Polymer Science, 123, 2177-2183. (IF 2010 : 1.240)

Mikkonen K. S., Stevanic J. S., Joly C., Dole P., Pirkkalainen K., Serimaa R., Salmen, L., Tenkanen M. (2012) Composite films from spruce galactoglucomannans with microfibrillated spruce wood cellulose. Cellulose, 18, 713-726. (IF 2012 : 3.476)

Hatzigrigoriou N. B., Vouyiouka, S.N., Joly C., Dole P. ; Papaspyrides, C. D. (2012). Temperature-humidity superposition in diffusion phenomena through polyamidic materials. Journal of Applied Polymer Science, 125, 2814-2823. (IF 2010 : 1.240)

2011 : 10 articles (dont 3 sans IF)

Kouadio I.A., Oulahal N., Nguyen-Thi P., Adt I., Degraeve P. (2011). Study of the antimicrobial activities of Solanum indicum ssp. Distichum (Shumach and Thonning 1827) fruits (“gnangnan” berries) from a tropical humid zone (Côte d’Ivoire). International Journal of Biological and Chemical Sciences, 5, 1190-1200.

Ly-Chatain M.-H., Durand L., Rigobello V., Vera A., Demarigny Y. (2011). Direct quantitative detection and identification of lactococcal bacteriophages from milk and whey by real-time PCR : application for the detection of lactococcal bacteriophages in goat’s raw milk whey in France. volume 2011, article ID 594369, 9 pages
International Journal of Microbiology and Biotechnology

Dissa A.O., Desmorieux H., Degraeve P., Bathiebo J., Koulidiati J. (2011). Impact of fruit ripeness on physicochemical properties and convective drying characteristics of Kent mango (Mangifera indica L. cv. ‘Kent’). International Journal of Food Engineering, 7, Issue 3 (IF 2010 : 0.388)

Brunon C., Chadeau E., Oulahal N., Grossiord C., Dubost L., Bessueille F., Simon F., Degraeve P., Leonard D. (2011). Characterization of PECVD-PVD transparent deposits on textiles to trigger various antimicrobial properties to food industry textiles. Thin Solid Films, 519, 5838-5845 (IF 2010 : 1.975)

Mariani C., Oulahal N., Chamba J.-F., Dubois-Brissonnet F., Notz E., Briandet R. (2011). Inhibition of Listeria monocytogenes by resident biofilms present on wooden shelves used for cheese ripening. Food Control, 22, 1357-1362. (IF 2010 : 2.812)

Adt I., Dupas C., Boutrou R., Oulahal N., Noël C., Mollé D., Jouvet T., Degraeve P. (2011). Identification of caseinophosphopeptides generated through in vitro gastro-intestinal digestion of Beaufort cheese. International Dairy Journal, 21, 129-134. (IF 2010 : 2.101)

Brunon C., Bessueille F., Grossiord C., Chadeau E., Oulahal N., Darroux C., Ferreira I., Bourgeois M., Simon F., Rimbault F., Yu C., Leonard D. (2011). ToF-SIMS and XPS characterization of antimicrobial textiles for the food-processing industry. Surface and Interface Analysis, 43, 604-608. (IF 2010 : 1.249)

Jbilou F., Galland S., Ayadi F., Belard L., Dole P., Desjardin V., Bayard R., Degraeve P. (2011). Biodegradation of corn flour-based materials assessed by enzymatic, aerobic, and anaerobic tests : influence of specific surface area. Polymer Testing, 30, 231-239. (IF 2010 : 2.016)

Demarigny Y., Dalmasso M., Tonleu A., Rigobello V., Beuvier E., Ly-Chatain M.-H., Bouton Y. (2011). Influence of the backslopping practice on the microbial diversity of the Lactococcus population in a model cheesemaking. Food and Nutrition Sciences, 2, 618-627. (pas encore d’IF)

Zhanga Y, ,Pitkanen L., Douglade J, Tenkanen M, Remond,C, Joly C (2011). Wheat bran arabinoxylans : Chemical structure and film properties of three isolated fractions. Carbohydrate Polymers, 86, 852-859.(IF 2012 : 3.479)

2010 : 3 articles avec IF

Guiga W., Swesi Y., Galland S., Peyrol E., Degraeve P., Sebti I. (2010). Innovative multilayer antimicrobial films made with Nisaplin® or nisin and cellulosic ethers : Physico-chemical characterization, bioactivity and nisin desorption kinetics. Innovative Food Science and Emerging Technologies, 11, 352-360. (IF 2009 : 2.174)

Chadeau E., Oulahal N., Dubost L., Favergeon F., Degraeve P. (2010). Anti-Listeria innocua activity of silver functionalised textile prepared with plasma technology. Food Control, 21, 505-512. (IF 2009 : 2.463)

Messaoud M., Chadeau E., Brunon C., Ballet T., Rappenne L., Roussel F., Leonard D., Oulahal N., Langlet M. (2010). Photocatalytic generation of silver nanoparticles and application to the antibacterial functionalization of textile supports. Journal of Photochemistry and Photobiology A : Chemistry, 215, 147-156. (IF 2009 : 2.553)

2009 : 5 articles avec IF

Chollet E., Swesi Y., Degraeve P., Sebti I. (2009). Monitoring nisin desorption from a multi-layer polyethylene-based film coated with nisin loaded HPMC film and diffusion in agarose gel by an immunoassay (ELISA) method and a numerical modeling. Innovative Food Science and Emerging Technologies, 10, 208-214. (IF 2008 : 1.474)

Guiga W., Galland S., Peyrol E., Degraeve P., Carnet-Pantiez A., Sebti I. (2009). Antimicrobial plastic film : physico-chemical characterization and nisin desorption modelling. Innovative Food Science and Emerging Technologies, 10, 203-207. (IF 2008 : 1.474)

Oulahal N., Adt I., Mariani C., Carnet-Pantiez A., Notz E., Degraeve P. (2009). Examination of wooden shelves used in the ripening of a raw milk smear cheese by FTIR spectroscopy. Food Control, 20, 658-663. (IF 2008 : 1.980)

Dupas C., Adt I., Cottaz A., Boutrou R., Mollé D., Jardin J., Jouvet T., Degraeve P. (2009). A chromatographic procedure for semi-quantivative evaluation of caseinphosphopeptides in cheese. Dairy Science and Technology, 89, 519-529. (IF 2009 : 0.574)

Vera A., Rigobello V., Demarigny Y. (2009) Comparative study of culture media used for sourdough lactobacilli. Food Microbiology, 26, 728-733.(IF 2008 : 2.847)

2008 : 8 articles dont 1 sans IF

Dalmasso M., Prestoz S., Rigobello V., Demarigny Y. (2008). Behavior of Lactococcus lactis subsp lactis biovar. diacetylactis in a four Lactococcus strain starter during successive milk cultures. Food Science and Technology International, 14, 469-477. (IF 2007 : 0.632)

Oulahal N., Brice W., Martial A., Degraeve P. (2008). Quantitative analysis of survival of Staphylococcus aureus or Listeria innocua on two types of surfaces : polypropylene and stainless steel in contact with three different dairy products. Food Control, 19, 178-185. (IF 2007 : 1.823)

Guillemin A., Degraeve P., Noël C., Saurel R. (2008). Influence of impregnation solution viscosity and osmolarity on solute uptake during vacuum impregnation of apple cubes (var. Granny Smith). Journal of Food Engineering, 86, 475-483. (IF 2007 : 1.848)

Guillemin A., Guillon F., Degraeve P., Rondeau C., Devaux M.F., Huber F., Badel E., Saurel R., Lahaye M. (2008). Firming of fruit tissues by vacuum infusion of pectin methylesterase : visualization of enzyme action. Food Chemistry, 109, 368-378. (IF 2007 : 3.052)

Asséré A., Oulahal N., Carpentier B. (2008). Comparative evaluation of methods for counting surviving biofilm cells adhering to a Polyvinyl Chloride (PVC) surface exposed to chlorine or drying. Journal of Applied Microbiology, 104, 1692-1702. (IF 2007 : 2.501)

Chollet E., Sebti I., Martial-Gros A., Degraeve P. (2008). Nisin preliminary study as a potential preservative for ripened cheese : NaCl, fat and enzymes influence on nisin concentration and its antimicrobial activity. Food Control, 19, 982-989. (IF 2007 : 1.823)

Dalmasso M., Prestoz S., Rigobello V., Demarigny Y. (2008). Evolution of the raw milk microflora, especially lactococci, enterococci, leuconostocs and lactobacilli over a successive 12 day milking regime. International Journal of Dairy Science, 3, 117-130.

Dalmasso M., Hennequin D., Duc C., Demarigny Y. (2008). Influence of backslopping on the acidifications curves of “Tomme” type cheeses made during 10 successive days. Journal of Food Engineering, 92, 50-55. (IF 2007 : 1.848)

2007 : 3 articles avec IF

Sebti I., Chollet E., Degraeve P., Noël C., Peyrol E. (2007). Water sensitivity, antimicrobial, and physico-chemical analyses of edible films based on HPMC and/or chitosan. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 55, 693-699. (IF 2006 : 2.322)

Oulahal N., Martial-Gros A., Bonneau M., Blum L.J. (2007). Removal of meat biofilms from surfaces by ultrasounds combined with enzymes and/or a chelating agent. Innovative Food Science & Emerging Technologies, 8, 192-196. (IF 2007 : 1.713)

Mariani C., Briandet R.,. Chamba J-.F., Notz E., Carnet-Pantiez A., Eyoug R.N., Oulahal. N. (2007). Biofilm ecology of wooden shelves used in ripening the French, raw milk, smear cheese, Reblochon de Savoie. Journal of Dairy Science, 90, 1653-1661. (IF 2006 : 2.284)

2006

Ripoche-Carnet A., Chollet E., Peyrol E., Sebti I.(2006). Evaluation of nisin diffusion in a polysaccharide gel : influence of agarose and fatty content. Innovative Food Science and Emerging Technology, 7, 107-111.

Guillemin, A., Degraeve, P., Guillon, F., Lahaye, M., Saurel, R. (2006). Incorporation of pectinmethylesterase in apple tissue either by soaking or by vacuum impregnation. Enzyme and Microbial Technology, 38, 610-616.

Durrieu, C., Degraeve, P., Chappaz, S. & Martial, A. (2006). Immunomodulating effects of water-soluble extracts of traditional French Alps cheeses on a human T-lymphocyte cell line. International Dairy Journal, 16, 1505-1514.

Demarigny Y., Sabatier C., Laurent N., Prestoz S., Rigobello V., Blachier M-.J. (2006). Microbiological diversity in natural whey starters used to make traditional rocamadour goat cheese and possible relationships with its bitterness. Italian Journal of Food Science, 18, 261-276. (IF 2006 : 0.506)

2005

Sebti I., Martial-Gros A., Carnet-Pantiez A., Grelier S., Coma. V. (2005). Chitosan polymer as bioactive coating and film against Aspergillus niger contamination. Journal of Food Science, 70, 100-104.

Durrieu, C., Degraeve, P., Carnet-Pantiez, A., Martial, A. (2005). Assessment of the immunomodulatory activity of cheese extracts by a complete and easy to handle in vitro screening methodology. Biotechnology Letters, 27, 969-975.

Demarigny Y., Hennequin D., Barillier D. (2005) Utilisation of the experimental design methodology to reduce browning defects in hard cheese technology. Journal of Food Engineering, 68, 481-490.

2004

Oulahal N., Martial-Gros A., Bonneau M., Blum L.J. (2004). Combined effect of chelating agents and ultrasound on biofilm removal from stainless surfaces. Application to "Escherichia coli milk" and "Staphylococcus aureus milk" biofilms. Biofilms, 1, 65-73.

Saurel R., Pajonk A., Andrieu J. (2004). Modelling of French Emmental Cheese water activity during salting and ripening periods. Journal of Food Engineering, 63, 163-170.

2003

Sebti I., Delves-Broughton J., Coma V. (2003). Physicochemical properties and bioactivity of nisin-containing cross-linked hydroxypropylmethylcellulose films. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 51, 6468-6474.

Coma V., Deschamps A., Martial A. (2003). Bioactive packaging materials from edible chitosan polymer-antimicrobial activity : assessment on dairy-related contaminants. Journal of Food Science, 68, 2788-2792.

Sebti I., Carnet-Ripoche A., Blanc D., Saurel R., Coma V. (2003). Controlled diffusion of an antimicrobial peptide from a biopolymer film. Transactions in Chemical Engineering, 81, 1099-1104.

Sebti I., Blanc D., Carnet-Pantiez A., Saurel R., Coma V. (2003). Experimental study and modeling of nisin diffusion in agarose gels. Journal of Food Engineering, 63, 185-190.

Degraeve P., Martial A. (2003). Purification and partial characterisation of X-propyl dipeptidyl aminopeptidase of Lactobacillus helveticus ITG LH1. International Dairy Journal, 13, 497-507.

Parrot S., Degraeve P., Curia C., Martial A. (2003). In vitro study on digestion of peptides in emmental cheese : analytical evaluation and influence on angiotensin I converting inhibitory peptides. Nahrung/Food (devenu Molecular Nutrition and Food Research), 2, 87-94.

Cattaneo T. M. P. , Avitabile Leva A., Maraboli A., Saurel R., Torreggiani D. (2003). Improvement of pear yoghurt ingredients using vacuum infusion. Italian Journal of Food Science, 15, 269-276.

Degraeve P., Saurel R., Coutel Y. (2003). Vacuum impregnation pretreatment with pectinmethylesterase to improve firmness of pasteurized fruits.
Journal of Food Science, 68, 716-721.

Pajonk A., Saurel R., Andrieu J. (2003). Experimental study and modeling of effective NaCl diffusion coefficients values during emmental cheese brining. Journal of Food Science, 60, 307-313.

Pajonk A., Saurel R., Andrieu J., Laurent P., Blanc D. (2003). Heat transfer study and modeling during emmental ripening. Journal of Food Engineering, 57, 249-255.

Oulahal N., Martial A., Bonneau M., Blum L.J. (2003). Escherichia coli-milk biofilm removal from stainless steel surface : synergism between ultrasonic waves and enzymes. Biofouling, , 19, 159-168.

2002

Sebti I., Coma V. (2002). Active edible polysachharide coating and interactions between solution coating compounds. Carbohydrate Polymers, 49, 139-144.

Coma V., Sebti I., Pardon P., Pichavant F.H., Deschamps A. (2002). Film properties from crosslinking of cellulosic derivatives with a polyfunctional carboxylic acid. Carbohydrate Polymers, 51, 265-271.

Sebti I., Pichavant F. H. , Coma V. (2002). Edible bioactive fatty acid – cellulosic derivatives composites to food packaging applications. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 50, 4290-4294.

Coma V., Martial-Gros A., Garreau S., Copinet A., Salin F., Deschamps A. (2002). Edible antimicrobial films based on chitosan matrix. Journal of Food Science, 67, 1162-1169.

2001

Coma V., Sebti I., Pardon P., Deschamps A., Pichavant F. H. (2001). Antimicrobial edible packaging based on cellulosic ethers, fatty acids, and nisin incorporation to inhibit Listeria innocua and Staphylococcus aureus. Journal of Food Protection, 64, 470-475.

2000

Oulahal-Lagsir N., Martial-Gros A., Bonneau M., Blum L. J. (2000). Ultrasonic methodology coupled to ATP bioluminescence for the non-invasive detection of fouling in food processing equipment - validation and application to a dairy factory. Journal of Applied Microbiology, 89, 433-441.

Oulahal-Lagsir N., Martial-Gros A., Boistier E., Blum L. J., Bonneau M. (2000). The development of an ultrasonic apparatus for the noninvasive and repeatable removal of fouling in food processing equipment. Letters in Applied Microbiology, 30, 47-52.

Collaborations

Collaborations nationales :

Établissements universitaires et de recherche :

- INSA de Lyon

  • Laboratoire de Génie Civil et d’Ingénierie Environnementale

- Institut National de la Recherche Agronomique (UMRs avec AgroParisTech, AgroCampusRennes et l’Université de Reims)

  • Bioadhésion et Hygiène des Matériaux (UBHM), Dr Romain BRIANDET, Massy
  • Fractionnement des Agro-Ressources et Environnement (FARE), Dr Patrice DOLE, Reims
  • Sciences & Technologies du Lait et de l’Œuf , Dr Valérie GAGNAIRE, Rennes

- AgroSup’ Dijon

- AgroParisTech

- Université Jean Monnet, Saint-Etienne.

Réseaux nationaux

- RMT Propack Food

  • coordination de recherches dans le domaine de l’emballage des aliments réalisées dans les universités, à l’INRA, dans les centres techniques (ACTIA, MAP).

- RMT CHLEAN

  • Conception Hygiénique des Lignes & Equipements et Amélioration de la Nettoyabilité

- Réseau National Biofilms

  • réunions des groupes s’intéressant aux biofilms microbiens

Centres techniques

- Actilait/Institut Technique des Produits Laitiers (Bourg-en-Bresse)

  • hygiène & produits laitiers, fragments peptidiques bioactifs de protéines laitières

- Centre Technique de la Conservation des Produits Agricoles (Bourg-en-Bresse)

  • sécurité alimentaire des emballages

- Pôle Européen de Plasturgie

  • emballages actifs & biodégradables

- Institut Français du Textile et de l’Habillement

  • textiles antimicrobiens

Industriels

- Philibert Savours

Collaborations internationales :

- Universita di Padova (Padoue, Italie) :

Peptides antimicrobiens dans le fromage d’Asiago

  • Dr Severino SEGATO (Dept of Animal Science)
  • Pr Enrico NOVELLI (Dept of Public Health, Comparative Pathol. and Veterinary Hygiene)

- Institut des Régions Arides (Medenine, Tunisie) :

Composés antimicrobiens du lait de chamelle

  • Pr Touhami KHORCHANI,
  • Dr Halima EL HATMI,
  • Zeineb JRAD (doctorante)

- Université de Carthage / INSAT (Tunis, Tunisie)

- Faculty of Food Science & Technology (Hô Chi Minh Ville, Vietnam) :

Mécanismes de bioprotection par les bactéries lactiques d’aliments fermentés traditionnels

  • Pr Dong PHAN THE,
  • Phuong NGUYEN THI (doctorante)

Informations pratiques

BioDyMIA

  • Site de Bourg en Bresse (IUT Lyon 1)

Technopole Alimentec,

rue Henri de Boissieu,

01000 Bourg en Bresse

Tel : +33 (0)4 74 45 52 52

Fax : +33 (0)4 74 45 52 53

E-mail : Biodymia.direction@univ-lyon1.fr

  • Site de Lyon (ISARA) :

ISARA,

Département Production Agro-Alimentaire et Qualité,
Agrapôle,

23 rue Jean Baldassini,

69364 Lyon cedex 07

Membres

Les thématiques de BioDyMIA étant pluridisciplinaires, le laboratoire est organisé en trois pôles de compétences qui interagissent : biochimie analytique, microbiologie, physicochimie/procédés. Cliquez dans le menu de gauche pour accéder aux C.V. des membres du laboratoire (en anglais).

Pôle Biochimie Analytique

PDF - 101.5 ko

Isabelle Adt (responsable du pôle)

PDF - 75.7 ko

Pascal Degraeve

PDF - 89.3 ko

Coralie Dupas-Farrugia

Pôle Physico-chimie/Procédés

PDF - 67.1 ko

Catherine Joly (responsable du pôle physico-chimie)

PDF - 94.1 ko

Sophie Galland

PDF - 314.3 ko

Adem Gharsallaoui

Pôle Microbiologie

PDF - 58 ko

Sophie Orenga

Service Technique

Service Administratif

Offres de stages

Plaquette du laboratoire

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Thèses en cours

Stagiaires, Doctorants...

BioDyMIA accueille régulièrement de nombreux stagiaires de tous horizons, ainsi qu’un certain nombre de doctorants et post-doctorants. Les lister tous ici serait impossible, mais nous les remercions chaleureusement pour leur contribution aux travaux de recherche de l’équipe.

La joyeuse équipe de non-permanents en juin 2012 :

...et leurs successeurs de 2013 :

Thèses soutenues

Ces travaux de thèse ont été effectués en intégralité, ou en partie, au laboratoire :

et Docteurs de BioDyMIA

Ils/Elles ont travaillé à BioDyMIA, pour 3 ans ou pour un moment, et ont obtenu le titre de Docteur :

Doctorants...