Biodymia

Lucie LEONARD

2012-05-02T10:33:47Z

lucie.leonard@ univ-lyon1.fr

Address : BioDyMIA EA n°3733 Université Claude Bernard Lyon 1 IUT - Département Génie Biologique Technopole Alimentec - Rue Henri de Boissieu F-01 000 Bourg en Bresse tel : +33 (0)4 74 45 52 55 / +33 (0)6 81 84 61 84

Skills

food science
microbiology
biochemistry (chemistry applied to living)
biochemical engineering

Positions/Education

Education
- since oct. 2010 : PhD thesis Lyon1 University/Burgundy University Entrapment of microorganisms in polymeric matrices for a bioprotective packaging application

- 2009/2010 : Master Degree in Organic, Bioorganic and Environmental Chemistry (COBE) (research master) Blaise Pascal University, Clermont-Ferrand

- 2007/2010 : Polytech, school of engineering of Blaise Pascal University, Clermont-Ferrand (Master's student (French diploma : “diplôme d'ingénieur”) specializing in Biological Engineering)

- 2004/2007 : Preparation course for the admission to top French graduate schools (University Engineering Schools) Specialities : Physics and Chemistry Lycée Gay Lussac, Limoges

Positions
- since oct. 2010 : Junior Research Fellow in the context of my thesis (Lyon1 University/Burgundy University) Entrapment of microorganisms in polymeric matrices for a bioprotective packaging application

- Feb. 2010/Jul. 2010 : Ulice (Limagrain Céréales Ingrédients) – Riom, France Research centre to characterize and analyze functionalities of raw grain. Six month final placement. Subject : Modification of grain substrates (starch) using enzymes. Methods : size-exclusion chromatography, RVA-Rapid Visco Analyser, DSC-Differential Scanning Calorimetry. I made the scientific monitoring about the project, developed the methods, made and planed the experimentations. I analysed and presented the results.

- May/Jul. 2009 : Copenhagen University (LIFE), Food Science Department – Copenhagen, Denmark Three month-placement. Subject : Screening of potential antioxidants for food systems. Methods : ESR-Electron Spin Resonance, oxygen consumption measurement

- - Teaching activities
    - 2010/2011 and 2011/2012 : Department of Biological Engineering (Specialty : Food and Biological Industry), IUT Lyon 1 – Bourg-en-Bresse Analytical biochemistry (36h lab + 6h tutorials annually)

Research activities : BioDyMIA EA n°3733, Université Lyon 1 - site de Bourg en Bresse UMR PAM, PAPC, AgroSup Dijon, Université de Bourgogne, Dijon
- Research topics :
Entrapment of microorganisms in polymeric matrices for a bioprotective packaging application Biopolymers used : sodium caseinate/sodium alginate water in water emulsion (multiphasic system) Microorganisms : lactic acid bacteria (for example Lactococcus lactis) Target bacteria : Listeria spp. Methods : antimicrobial activity determination by agar well diffusion assay and by bioscreen® assay (liquid medium) ; matrice gelification by calcium adjunction (beads formation by Nisco encapsulation unit VarV1 LIN-0119 (Nisco Engineering AG, Zurich, Switzerland) and gel formation) ; gel filtration chromatography ; SDS-Page electrophorese ; epifluorescence microscopy (Axiovert 25 CFL, Carl Zeiss, Iena, Germany)

Part of the projet : « Bioprotective microorganisms and packaged foods preservation » (2010-2013) co-funded by Fonds de Développement de la Recherche du Technopole Alimentec and Région Bourgogne (PARI Agrale N°3 « Matbio Vectorisation ») Partnership : PAPC (UMR PAM)-AgroSup Dijon- Université de Bourgogne, Gpack company-St Martin du Fresne, Actilait (French Technical Institute for Dairy Products)-Bourg en Bresse, Centre Technique de la Conservation des Produits Agricoles (CTCPA)-Bourg en Bresse and Technopole Alimentec-Bourg en Bresse.

Scientific production Posters

Léonard L., Gharsallaoui A., Chouchène I., Ouaali F., Degraeve P., Saurel R., Oulahal N. “Anti-Listeria activity of calcium alginate and calcium alginate caseinate matrices entrapping Lactococcus lactis”. MATBIM 2012-2nd international meeting on material/bioproduct Interaction. Dijon, France (22nd -25th april 2012).
Léonard L., Dumas E., Jamet E., Degraeve P., Saurel R., Gharsallaoui A.,Oulahal N. “Selection of Lactic Acid Bacteria (LAB) strains for bioprotective application with LAB entrapment in polymeric matrices (First step : Selection o

"Activité antimicrobienne d'huiles essentielles de plantes du Nord du Maroc" (Thèse de Lamia CHERRAT)

2012-04-19T13:18:41Z

Lamia CHERRAT (doctorante de la Faculté des Sciences et Techniques de Tanger encadrée par le Pr Amin LAGLAOUI, ERBGB (Equipe de Recherche en Biotechnologie et Génie des Biomolécules) a terminé son séjour de 6 mois dans le cadre de ses travaux de thèse sur l'activité antimicrobienne d'huiles essentielles de plantes du Nord du Maroc le 13 avril 2012. Elle a travaillé avec Nadia OULAHAL et Emilie DUMAS sur les perturbations de la fluidité membranaire et de la physiologie de Listeria innocua induites par (...) - Thèses en cours

"Exploitation des propriétés antimicrobiennes d'huiles essentielles pour la conservation de matrices alimentaires" (Thèse de Nga TRINH THI THANH)

2012-04-19T13:17:22Z

Nga TRINH THI THANH (Institut Polytechnique de Hanoï) terminera sa première période de thèse en co-tutelle au laboratoire le 30 juin 2012. Elle travaille sur l'exploitation des propriétés antimicrobiennes d'huiles essentielles pour la conservation de matrices alimentaires. - Thèses en cours

"Mélanges de polymères biodégradables incompatibles à base d'amidon plastifié et de Polybutylène succinate : influence de la morphologie sur les propriétés de transport" (Thèse de Fadi KHALIL)

2012-04-19T13:14:58Z

Directeur de thèse : Pascal Degraeve (BioDyMIA, Lyon1)

Co-encadrantes : Sophie Galland, Catherine Joly.

Présentation du sujet :

La bio-protection ou bio-préservation des aliments (ou des produits de santé) met en jeu la migration contrôlée d'entités anti-microbiennes libérées à partir de polymères hôtes formulés préalablement, ceci par opposition aux stratégies de formulation des aliments en présence de « conservateurs ». Ce phénomène de migration est largement étudié/modélisé dans le contexte sanitaire relatif à la contamination des aliments par les additifs initialement présents dans les polymères d'emballage. Des modèles statistiques empiriques et les lois de transport (basées sur les lois de Fick) ont permis le développement de modèles mathématiques ou de serveur dédié permettant si ce n'est de modéliser le transfert, le dimensionnement des expériences de migration.

Cependant, certains domaines restent peu explorés. Le cas des additifs de masse moléculaire supérieure à 1000 g/mol, ou l'activation des phénomènes de transport par l'humidité surtout dans le domaine des polymères polaires souvent protégés lors d'un contact alimentaire classique. Ce travail de thèse a pour but d'appréhender les phénomènes de transport par l'intermédiaire d'un set de migrants modèles de masses moléculaires variables et de structures chimiques permettant de diversifier les interactions migrant/matrice : la recherche de telles séries homologues (en masse molaire et/ou paramètres d'interactions) est un premier effort de recherche.

Les polymères hôtes polaires sélectionnés ne permettent pas d'atteindre les propriétés d'usage requises pour un matériau d'emballage (propriétés mécaniques notamment et variabilité de celles-ci selon leur état d'hydratation). Des mélanges de polymères incompatibles sont mis en œuvre afin de pallier les déficiences des polymères polaires et d'étudier l'influence de la (des) morphologie(s) retenue(s) sur les propriétés de diffusion dans la zone dite de co-continuité partielle ou totale où les comportements diffusionnels peuvent présenter des particularités d'intérêts avec également un relargage par exemple déclenché par l'eau.

De manière applicative, la finalité de ce travail portera sur la réalisation d'un/de système(s) réels avec transport d'entité anti-microbienne sélectionnée (i.e. bactériocine telle que la Nisine), dont le transport pourrait être activé de manière originale par l'eau apportée par le produit alimentaire conditionné. L'activité antimicrobienne pourra être évaluée dans ce contexte applicatif.

Méthodologie retenue :

Partie 1 : Réalisation de mélanges TPS/PBS thermodynamiquement incompatibles par voie fondue

Partie 2 : Morphologie des mélanges par extraction sélective des phases en présence en milieu solvant, sorption de molécules volatiles , désorption de molécules marquant la phase amylacée. Sélection de mélanges de morphologies co-continues partielle ou totale.

Partie 3 : Sélection de migrants présentant des coefficients de partage favorables à la phase TPS. Réalisation de formulations ternaires TPS/PBS/migrants seuls ou en mélange.

Partie 4 : Impact de la morphologie des mélanges de polymères sur le transport des migrants sélectionnés dans des simulants ou matrices alimentaires modèles – activation par l'eau.

Partie 5 : Application au transport de bactériocine et activité antimicrobienne de films modèles.

Moyens techniques :

Extrusion monovis de laboratoire ou mélangeur interne (type brabender) ;

MEB, extracteurs Soxhlet, sorption d'eau,

Montages de désorption et/ou migration de composés d'intérêts (méthodes spectroscopiques et chromatographpiques)

Partenaires du projet :

Centre Technique de la Conservation des Produits Agricoles (CTCPA)-Bourg en Bresse

IMP-UJM - Ingénierie des Matériaux Polymères [http://portail.univ-st-etienne.fr/b...]

"Caractérisation de l'activité antimicrobienne d'extraits hydrosolubles du fromage d'Asiago." (Thèse de Phuong NGUYEN THI)

2012-04-19T13:14:28Z

Phuong NGUYEN THI (Université Nông Lâm) terminera sa dernière période en France de thèse en co-tutelle le 30 juin 2012. Son sujet est la caractérisation de l'activité antimicrobienne d'extraits hydrosolubles du fromage d'Asiago. - Thèses en cours

"Évaluation du potentiel bioprotecteur de bactéries lactiques (LAB) aux interfaces en fonction de leur mode de mise en œuvre et de leur microenvironnement."(Thèse de Lucie LEONARD)

2012-04-19T13:12:56Z

Date de début de thèse : 1er octobre 2010
Doctorante : Lucie LEONARD
Directeurs de thèse : Nadia OULAHAL (BioDyMIA, Lyon1), Rémi SAUREL (PAPC, UMR PAM, Agrosup'Dijon, uB)

Présentation du sujet

Cette thèse (en co-direction) se déroule au sein de deux unités de recherche sur 18 mois de part et d'autre :

BioDyMIA (Bioingénieurie et Dynamique Microbiennes aux Interfaces Alimentaires), Lyon1 – Isara et Equipe PAPC (UMR PAM),
Agrosup'Dijon, Université de Bourgogne.

Les objectifs de la thèse et la méthodologie retenue ont été réparties en 5 parties :

partie 1 : Sélection des souches de bactéries lactiques (LAB) en fonction de leurs propriétés antimicrobiennes
partie 2 : Mise en œuvre du mélange biphasiques de Na-Alginate/Na-Caséinate thermodynamiquement incompatibles
partie 3 : Viabilité des cellules de LAB immobilisées en fonction des conditions de stockage de la matrice
partie 4 : Impact de l'immobilisation des cellules de LAB sur les propriétés physicochimiques de la matrice
partie 5 : Efficacité antimicrobienne de la matrice contre Listeria

Moyens techniques

Biopolymères utilisés : emulsion eau dans eau de caséinate de sodium et d'alginate de sodium (système multiphasique)
Microorganismes d'intérêt : bactéries lactiques (exemple Lactococcus lactis)
Bactéries cibles : Listeria spp.
Méthodes utilisées :
- Détermination de l'activité antimicrobienne (méthode de diffusion en puits sur milieu gélosé, traitement par Bioscreen® (milieu liquide) ;
- Gélification de la matrice par addition de calcium (formation de bille en utilisant l'encapsulateur « Nisco encapsulation unit VarV1 LIN-0119 (Nisco Engineering AG, Zurich, Switzerland) » et formation de « gel à plat ») ;
- Chromatographie d'exclusion ; électrophorèse SDS-Page ; microscopie à épifluorescence (Axiovert 25 CFL, Carl Zeiss, Iena, Germany)

Autres

Thèse faisant partie du projet : « Microrganismes en milieu confiné_Application aux emballages bioprotecteurs » (2010-2013)
cofinancée par « Fonds de Développement de la Recherche du Technopole Alimentec » et la Région Bourgogne (PARI Agrale N°3 « Matbio Vectorisation »)
Partenaires du projet :
- PAPC (UMR PAM)-AgroSup Dijon- Université de Bourgogne,
- Gpack company-St Martin du Fresne,
- Actilait (Centre technique dédié aux lait et produits laitiers)-Bourg en Bresse,
- Centre Technique de la Conservation des Produits Agricoles (CTCPA)-Bourg en Bresse
- Technopole Alimentec-Bourg en Bresse.

« Utilisation de protéines laitières pour la fabrication de films actifs pour l'emballage : étude des propriétés barrières aux gaz, antibactériennes et de biodégradabilité. » (Thèse de Basak Yilin COLAK)

2012-04-19T13:11:40Z

Basak Yilin COLAK a débuté sa thèse à l'Université Jean Monnet de St Etienne dans l'unité « Ingénierie des Matériaux Polymères (IMP) » le 1er octobre 2011.

« Utilisation de protéines laitières pour la fabrication de films actifs pour l'emballage : étude des propriétés barrières aux gaz, antibactériennes et de biodégradabilité. »

Elle bénéficie d'une Allocation Doctorale de Recherche de la Région Rhône-Alpes dans le cadre du cluster de recherche Région Rhône Alpes (MACODEV : Matériaux et Conception pour un Développement Durable) (désormais intégré dans l'ARC (Communauté de Recherche Académique) Environnement)

La thèse se déroule principalement sur le site de St Etienne de l'IMP, elle est co-dirigée par le Dr Frédéric PROCHASZKA de l'IMP et Pascal DEGRAEVE. Sophie GALLAND co-encadre avec Pascal DEGRAEVE (contribution de BioDyMIA : fonctionnalisation antimicrobienne).

Partenaires :

Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale (LGCIE),
MecaFonction (Heyrieux, 38),
Laita (Epi-Ingrédients) (Créhen, 22),
ARDDI (Ardèche Déchets Industriels) (St Romain d'Ay, 07).

Les travaux sur l'évaluation de la stabilité de l'activité du lysozyme après extrusion gonflage pour obtenir des films antimicrobiens à base de caséines ont débuté.

« Développement de ferments aromatiques destinés aux produits de viennoiserie » (Thèse de Laëtitia GEMELAS)

2012-04-19T13:05:46Z

Laëtitia GEMELAS (auparavant en Master puis en contrat sur le projet CASDAR sur la flore des laits crus) a débuté sa thèse en convention CIFRE le 1er mars dernier avec l'entreprise Philibert Savours, sur le site de Lyon : « Développement de ferments aromatiques destinés aux produits de viennoiserie » - Thèses en cours

Journée BioDyMIA 26 mai 2011 : un franc succès !

2011-05-29T09:03:00Z

Journée du laboratoire BIODYMIA

« LA CONSERVATION DES ALIMENTS A HUMIDITE INTERMEDIAIRE » 26 mai 2011 - Bourg en Bresse

Le 26 mai 2011 a eu lieu la 1ère "journée BioDyMIA". Un franc succès qui a réuni le temps d'une journée chercheurs et professionnels de l'agroalimentaire.

« De la conservation des aliments traditionnels fermentés aux innovations les plus récentes pour la conservation des aliments prêts à l'emploi, comme les emballages antimicrobiens »…tels étaient les thèmes de recherche débattus.

"Le Progrès" a eu l'amabilité de nous consacrer un article.

Si vous souhaitez consulter le programme au format pdf, cliquez sur l'icône :

A suivre : compte-rendu et photos de la journée.

Soutenance de Thèse de Fouzia JBILOU

2011-04-23T20:22:38Z

Fouzia JBILOU, doctorante au laboratoire, a soutenu sa thèse intitulée :

« Elaboration de matériaux à base de farine de maïs : évaluation et compréhension des relations entre structure et cinétique de biodégradation »

le vendredi 29 avril 2011 à 10h30.

Toutes nos félicitations !