Recrutement d'un Maître de conférences à BioDyMIA

MAITRE DE CONFERENCES

Section CNU 64

GENIE BIOLOGIQUE – GENIE FERMENTAIRE ET BIOREACTEURS

IUT Lyon 1 / BioDyMIA

ENSEIGNEMENT :

Deux formations sont portées par le Département : BUT Génie Biologique, parcours Sciences de l’Aliment et Biotechnologie (BUT GB SAB), en 3 ans (environ 170 étudiants ou alternants) et Licence Professionnelle QIAC (Qualité Intégrée des Aliments Conditionnés, environ 10 alternants).

L’équipe du Département est composée de 9 enseignants-chercheurs (dont la personne qui sera recrutée), 7 enseignants, 2 contractuels professionnels, 1 secrétaire et 3 personnels techniques.

Les enseignements à réaliser porteront sur les biotechnologies centrées sur le génie fermentaire et les bioréacteurs. Des compétences en mycologie et/ou microbiologie prévisionnelle, ainsi qu’une maitrise des logiciels de modélisation de croissance microbienne seraient appréciées.

Plus précisément, la personne recrutée sera amenée à enseigner (CM, TD, TP) dans les ressources suivantes :

• R3.01 Microbiologie du BUT, partie mycologie.
• R3.SAB.12 Physique industrielle et SAE 4.2 du BUT, partie régulation (boucle ouverte, fermée, caractérisation d’un système du premier ordre avec réponse à un échelon, régulateur Tout Ou Rien, régulateur PID).
• R4.SAB.09 Biotechnologie du BUT, partie microbiologie industrielle (définition et applications de la microbiologie industrielle, préparation de l’inoculum, composition qualitative et quantitative des milieux de culture, stérilisation, structure du bioréacteur avec les dispositifs de contrôle et régulation, modélisation mathématique des échanges gazeux et des cinétiques des cultures…).
• R5.01 Méthodes d’investigations et de contrôle en biologie du BUT et UE1Qualité Sécurité Sanitaire de la LP QIAC, partie mycotoxines.
• SAE 5.1 du BUT et UE1Qualité Sécurité Sanitaire de la LP QIAC, partie microbiologie prévisionnelle.

Un suivi dans le cadre de la SAE 5.1 du BUT 3^e année sera demandé. En effet, les compétences en génie fermentaire de la personne recrutée seront essentielles pour aider les étudiantes et étudiants dans leur projet présenté au concours Innov Aliment.

Afin de faciliter l’intégration au sein des équipes pédagogiques et de recherche, la personne recrutée bénéficiera d’une décharge d’enseignement en 1ère année, renouvelable sur demande la 2ème et la 3ème année. Enfin, la personne recrutée devra progressivement assumer des responsabilités d’animation pédagogique et administratives.

Environnement de travail : La partie enseignement dispose de :

• deux salles de TP de microbiologie / deux salles de TP de chimiebiochimie / une salle de TP de biologie / une salle de TP mécanique des fluides-électrotech / une salle de TP emballage / deux salles de TP informatique (14 ou 15 postes)
• une halle technologique avec des équipements professionnels et semiprofessionnels
• quatre salles de TD et une petite salle de TP hors informatique
• une grande salle de TD informatique (26 postes)
• une salle de TD mixte informatique (24 postes) et classique
• une grande salle pour les cours magistraux, pouvant accueillir environ 80 étudiantes et étudiants.

Par ailleurs, le site de Bourg-en-Bresse héberge 4 Départements : Informatique, Génie Biologique, Gestion des Entreprises et des Administrations et Métiers de la Transition et de l’Efficacité Energétiques.

Il dispose de 3 amphithéâtres, d’une bibliothèque et d’un restaurant universitaires, d’une infirmerie (une infirmière est présente quotidiennement sur le site de Bourg-en-Bresse) et d’un service informatique.

Autres informations :

• Sur le site internet de l’IUT Lyon 1, vous trouverez plus d’informations sur le BUT GB SAB et la LP QIAC.
• Nous avons en général entre 70 et 80 étudiants en BUT 1, entre 50 et 60 en BUT 2 et BUT 3.
• La plage horaire maximale de cours est 8h18h. Il y a au minimum 1h de pause déjeuner.
• L’alternance est majoritairement choisie par les étudiantes et étudiants de BUT 3. Les contrats d’alternance des BUT et LP sont gérés par l’IFRIA
• De nombreuses étudiantes et de nombreux étudiants réalisent des stages de BUT 2 et BUT 3 à l’étranger, en grande partie dans des laboratoires de recherche partenaires.

• Un Master Génie Alimentaire est porté par le Département Mécanique, pour lequel la 2^e partie des cours du M1 et toute l’année de cours du M2 ont lieu sur le site de Bourgen-Bresse. La 1ere année est en formation initiale et la 2^e année est en alternance. L’équipe pédagogique est mobilisée pour le suivi des stagiaires de M1 et des alternants de M2.
• La page Parcoursup pour le recrutement en 1ere année de BUT est consultable ici.
• Pour plus d’informations sur le Technopole Alimentec, vous pouvez consulter la page ici.

Contact enseignement :

Maxime GUERY, Chef de département - maxime.guery[at]univ-lyon1.fr

Tel : 04 74 45 52 52 (secrétariat) ou 52 57 (bureau) ou 06 76 91 51 00 (portable professionnel)

RECHERCHE :

BioDyMIA s’intéresse à la bioconservation des aliments périssables (principalement matrices carnées et poissons) pour en augmenter la durée de vie / améliorer la qualité. Les travaux du laboratoire vont de la recherche de nouveaux agents de préservation à leur identification/caractérisation. Ils incluent également l’étude de leurs mécanismes de mise en œuvre permettant de contrôler leur stabilité et leur cinétique d’action.

Dans le contexte de BioDyMIA, le concept de biopréservation s’entend au sens large puisque les agents de préservation considérés sont aussi bien des biomolécules (issues de co-produits alimentaires, produites par des micro-organismes…) que des bactéries antagonistes (principalement des bactéries lactiques) des flores d’altération ou pathogènes (notamment Listeria monocytogenes).

Cependant, bien que l’usage de biomolécules soit prometteur, la présence d’antagonistes et de risques de dégradation limite parfois leur action sur une durée suffisante par rapport à la durée de vie de l’aliment. L’usage de micro-organismes bioprotecteurs, est un moyen de pallier ces inconvénients. L’effet de biopréservation peut ici être lié à la présence même des bactéries (activité métabolique conduisant à la libération d’antimicrobiens tels que des bactériocines par exemple ou activité respiratoire). De ce fait, la question des caractéristiques idéales pour le choix d’une/des souches bioprotectrices se pose. Un autre intérêt de l’utilisation des souches bactériennes bioprotectrices réside en leur utilisation possible en synergie avec d’autres moyens de conservation conformément à la théorie des barrières (« hurdle technology »). Une originalité de BioDyMIA résulte dans son approche sur la mise en œuvre de ces agents, notamment en ce qui concerne les bactéries lactiques. Les problématiques rencontrées sont notamment celles de la stabilité des agents de biopréservation et de leurs modes de mise en œuvre pour favoriser leur action sur les micro-organismes indésirables ciblés.

De plus, le contrôle du développement de ces microorganismes bioprotecteurs nécessite une compréhension fine de la dynamique entre flore(s) d’altération, flore(s) banales, flore(s) protectrice(s) et/ou autres barrières au développement microbien dans l’aliment.

Dans ce contexte, la personne recrutée s’intégrera au sein d’une équipe pluridisciplinaire (microbiologie, biochimie, physico-chimie et génie des procédés) en mobilisant ses compétences en fermentation pour appréhender la croissance, la physiologie et/ou les interactions microbiennes en fonction notamment de la nature de milieux mimant la microstructure et la composition de matrices d’aliments périssables (voire sur matrice réelle) et de paramètres environnementaux (température, humidité, atmosphère gazeuse…). Une expérience en microbiologie prévisionnelle serait un plus.

Une grande motivation pour la recherche dans un contexte applicatif est attendue.

Quelques articles:

*Anti-Listeria activity of Lactococcus lactis subsp. lactis LAB3 cells entrapped in alginate beads: effects of inoculum size, alginate bead formulation, and atmosphere composition. He et al. (2025). Frontiers in Microbiology (https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2025.1663475/full)

*Bioprotective yeasts: Potential to limit postharvest spoilage and to extend shelf life or improve microbial safety of processed foods. He et al. (2024). Heliyon ⟨https://dx.doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e24929)

*Effect of the interaction of nisin Z with various polysaccharides on its antibacterial activity. Azari-Anpar et al. (2023). Food Control (10.1016/j.foodcont.2023.109874)

*Staphylococcus aureus membrane-damaging activities of four phenolics. Bouarab et al. (2021). FEMS Microbiology Letters (10.1093/femsle/fnab081)

*Antibacterial properties of polyphenols: characterization and QSAR (Quantitative Structure–Activity Relationship) models. Bouarab et al. (2019). Frontiers in Microbiology (https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2019.00829/full)

Contact recherche :

Isabelle ADT, Directrice de BioDyMIA, isabelle.adt[at]univ-lyon1.fr, tel : 04 74 47 21 48 (Ligne directe) ou 04 74 45 52 65 (secrétariat)

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